Uma nova versão do Pokémon Shuffle Mobile foi disponibilizada, o que requer que o jogo seja baixado novamente na PlayStore/AppStore. Amelia, a personagem do tutorial do jogo, irá aparecer novamente. Ela irá colocar marcadores em alguns pokémons, uma espécie de emblema dourado com a cara da Amelia. Esses marcadores servem para indicar os pokémons mais recomendados para serem capturados. No geral, são pokémons importantes de se obter para poder completar futuros estágios do jogo. Os pokémons podem ter até 3 marcadores. Quanto mais marcadores, mais recomendado é aquele pokémon.
Além disso, agora os estágios expert mostram o level recomendado que os seus pokémons devem estar antes que você desafie aquele estágio. Assim, você saberá o quanto deverá treinar o seu pokémon para conseguir um melhor desempenho nos estágios expert.
A interface de usuário também foi melhorada para dar uma melhor experiência de jogo. Os pokémons recomendados já capturados estarão com os marcadores da Amelia, conforme sua importância.
