A Game Freak havia revelado que não existiria uma update com as novas Mega Evoluções para X&Y, mas que os jogos seriam compatíveis entre sí, isto deixou muitos fãs confusos. Então a Serebii fez alguns esclarecimentos sobre essa compatibilidade, vamos a elas:
Batalhas
Será sim possível batalhas entre os jogos, mas com várias restrições. Primeiramente não será permitido usar nenhum dos novos ataques, mega evoluções, habilidades ou itens de OR & AS. E os Pokémon permitidos nas batalhas serão diferentes em cada game: em X&Y são permitidos Pokémon nascidos em Kalos ou transferidos de Unova. Já Omega Ruby e Alpha Sapphire serão permitidos apenas Pokémons originados em X&Y e nos próprios remakes.
Trocas
Trocas também serão bem afetadas. Não será possível trocar Pokémons de X&Y que estejam segurando o Discount Coupon. As novas Mega Stones não poderão ser transferidas para X&Y. Os outros itens ou Pokémon presentes em ambos os jogos poderão ser trocados sem problemas.
Pokémon Bank
Como o Pokémon Bank remove todos os itens antes de armazenar, as novas Mega Stones não serão um preoblema. Porém não ficou claro se os Pokémon com novos ataques poderão ser armazenados e não poderão ser retirados por X&Y, se eles teram algum “bloqueio” na hora de armazenar.
Fonte(s): Serebii