Kyurem VS. A Espada da Justiça
Na introdução ao mundo dos pokémons desse filme vemos todos os 648 pokémons existentes até então passarem pela tela (Ganesect só será revelado no próximo filme). Vemos uma breve batalha de Ash e Pikachu enfrentando um Druddigon. Em seguida vemos Ash, Iris, Cilan e seus pokémons avistando um trem que está passando. O filme começa numa área com um gramado alto e denso. Keldeo está treinando com Virizion. Ele detecta a presença de Virizion ouvindo o barulho do gramado e o persegue. Virizion acende sua espada, que surge em sua cabeça como um novo chifre. Keldeo tenta fazer o mesmo, mas não consegue ativar sua espada. Ele resolve atacar Virizion apenas com seu chifre comum. Cobalion e Terrakion assistem a cena. Em seguida vemos Keldeo treinando com Terrakion. Cobalion e Virizion assistem. Keldeo consegue evitar os golpes sem problemas e joga Terrakion numa grande montanha de rocha, que cai por cima de Terrakion. Ele acende a sua espada e destrói a montanha de rocha. Keldeo o ataca com seu chifre comum. A cena muda para Keldeo e Cobalion correndo numa floresta sob uma tempestade. Keldeo desafia Cobalion. Terrakion e Virizion estão assistindo. Cobalion ergue seu chifre-espada e ataca Keldeo. Keldeo diz que quer ser um espada da justiça e que quer enfrentar Kyurem, atacando Cobalion com seu chifre comum.
Vemos agora os três espadas da justiça reunidos, perguntando-se se Keldeo estaria pronto para enfrentar Kyurem. Cobalion diz que Keldeo ainda não cosegue ativar sua espada e que ainda não está pronto. Keldeo, que estava por perto, escuta e tenta convencê-los de que é capaz, sem sucesso. De noite, enquanto os espadas da justiça dormiam, Keldeo foge e vai ao encontro de Kyurem. Quando acordam, Cobalion, Terrakion e Virizion saem à procura de Keldeo. Keldeo chega ao local onde Kyurem habita e o desafia para uma batalha, clamando também ser um espada da justiça. Kyurem aceita o desafio e cria um campo de gelo. Cobalion, Terrakion e Virizion chegam ao local e encontram Keldeo batalhando com Kyurem. Na batalha, Kyurem quebra ao meio o chifre de Keldeo com sua garra, deixando o pobre pokémon paralisado e tremendo de medo. Terrakion não conseguiu ficar apenas olhando e resolveu intervir na batalha, mas é detido por Cobalion, dizendo que essa batalha era de Keldeo e eles não devem interferir até que ela esteja acabada. Kyurem se transforma no Kyurem Branco e congela o trio de espadas da justiça para que eles não interferissem na batalha. Ao ver seus amigos congelados, Keldeo é dominado pelo medo e foge da luta, enfurecendo Kyurem, que diz que essa batalha ainda não terminou.
Ash e seus amigos estão em um trem enquanto Pikachu e os outros estão brincando pelos vagões. Eles decidem parar numa estação e comprar algumas coisas na barraca de Malin, principalmente algumas de suas famosas lancheiras Darumaka. Carregado de lancheiras Darumaka, Ash tropeça em Scraggy deixando várias delas voar. Com a ajuda de Iris, Pikachu e os outros pokémons, conseguem pegar as lancheiras antes que elas caíssem no chão. O trem já estava partindo e todos tinham entrado, mas Scraggy havia ficado para trás. Ash consegue pegá-lo com a ajuda do chicote de Snivy. Pikachu percebe que alguma coisa caiu sobre o trem. Ash e os outros sobem e descobrem Keldeo completamente ferido. Eles tentam ajudá-lo, mas Keldeo dá um coice assustado. Ele dizia que Kyurem estava vindo. Iris diz já ter ouvido esse nome. Nesse instante, Kyurem aparece e pula sobre o trem. O grupo começa a correr, tentando proteger Keldeo. Quando tudo parecia pertido, o trem entra por um túnel, deixando Kyurem do lado de fora, enquanto os demais ficaram a salvo dentro do trem.
No trem, Iris conta uma história que ouviu da anciã de seu vilarejo dragão. Ela conta que Kyurem é o dragão mais forte do mundo e tem o poder de congelar. Chegando na cidade, o grupo leva Keldeo ao Centro Pokémon e dizem para a enfermeira Joy que ele estava sendo perseguido por Kyurem. Ela então conta a lenda dos três espadas da justiça e como Keldeo treina para ser um deles. Quando Keldeo se recupera, ele conta para Ash e seus amigos que para ser um espada da justiça é necessário enfrentar Kyurem. Ele conta como Kyurem congelou Cobalion, Terrakion e Virizion e fugiu depois disso. Ash, Iris e Cilan decidem ajudar Keldeo, mas antes resolver comer os lanches de suas lancheiras Darumaka.
Um lago próximo a cidade congela. É Kyurem que se aproxima, rodeado por dezenas de Cryogonal. Ele se transforma no Kyurem Branco e segue em busca de Keldeo. Iris conta aos demais que aprendeu com sua anciã que Kyurem pode se transformar no Kyurem Branco e no Kyurem Preto usando os poderes de Reshiram e Zekrom. O grupo é atacado pelos Cryogonal e começam a fugir. Ash manda Pikachu atacar o Kyurem Branco. Imediatamente ele se transforma no Kyurem Preto e contra-ataca. O grupo começa a ser perseguido pelos Cryogonal. Ash e Keldeo acabam se separando de Iris e Cilan. Ash e Keldeo são cercados pelos Cryogonal. Keldeo então esguicha água de sua quatro patas e começa a "voar" de uma maneira bem maluca, carregando Ash e conseguindo escapar. Eles avistam Iris e Cilan novamente. O grupo de Cryogonal chega e congela o lago. Ash manda seu Boldore para escorregar no lago congelado enquanto Keldeo e Pikachu atacam os Cryogonal. Eles se reúnem com Iris e Cilan e escapam por uma passagem que leva ao metrô subterrâneo da cidade.
No metrô eles encontram uma porta emperrada que é facilmente aberta com um coice de Keldeo. Cilan mostra que uma velha estação agora se tornou um museu de meios de transporte antigos. O grupo então arma um plano. Um dirigível sai de dentro do museu e voa para longe, com Iris pilotando. Um grupo de Cryogonal começa a perseguir o dirigível. Quando os Cryogonal tentam atacar, Iris mostra que está sozinha com Axew e Keldeo não está lá. Os Cryogonal vão embora, mas antes, o Kyurem Preto passa voando ao lado do dirigível, fazendo-o congelar e cair em algum lugar. Ash, Cilan e Keldeo encontram um velho carro de trem abandonado. Cilan usa a eletricidade de seu Stunfisk para movê-lo e foge, sendo perseguido pelos Cryogonal, enquanto Ash e Keldeo se separam e terminam o caminho a pé. Ash pergunta sobre os espadas da justiça e Keldeo conta como Terrakion é forte e engraçado, Virizion e rápido e inteligente e Cobalion é o grande mentor. Enquanto isso, Cilan foge dos Cryogonal pelos trilhos do trem. Ele entra em um túnel e manda Crustle atacar, derrubando os Cryogonal. No entanto, o Kyurem Preto que aguardava do outro lado congelou o carro de trem, mas Cilan disse que Keldeo não estava com ele. Kyurem muda para Kyurem Branco e parte para encontrar Keldeo novamente.
Finalmente Ash e Keldeo chegam ao local onde Kyurem habita, porém os Cryogonal e Kyurem, que volta para sua forma normal, chegam logo em seguida. Keldeo começa a tremer aterrorizado, lembrando da experiência que teve. Ash disse para ele não se preocupar e seguiu em frente. Keldeo ficou, tremendo. Enquanto isso, Iris, que havia ficado para trás, encontra Cilan. Ash encontra os três espadas da justiça congelados. Ele tenta quebrar o gelo com um bastão e com a ajuda de Pikachu, Pignite e Boldore. Kyurem se irrita e ataca, mas seu golpe é detido por Keldeo. Keldeo confessa ter mentido sobre ser um espada da justiça e diz que está apenas treinando para ser um, mas que lutará com Kyurem assim mesmo. Kyurem diz já saber de tudo isso. Ele cria novamente um campo de gelo e desafia Keldeo a entrar. Ele começa a tremer, mas Ash gritou para animá-lo. Iris e Cilan chegam no local. Keldeo se lembra de tudo que aprendeu e que seus amigos sempre estiveram com ele. Ele então fica decidido de seu objetivo e muda de forma para desafiar Kyurem.
Kyurem e Keldeo fazem uma árdua batalha. Iris e Cilan juntam-se a Ash e seus pokémons para tentar libertar os espadas da justiça. No meio da batalha, Kyurem consegue congelar uma pata de Keldeo, prendendo-o. Kyurem altera-se para Kyurem Preto e prepara-se para dar o golpe final. Não podendo ficar sem fazer nada, Ash manda seu Pikachu atacar Kyurem, mas é detido por um golpe de Keldeo, que se liberta e faz uma super combinação de golpes, acertando Kyurem. O impacto gera uma explosão que libertou Cobalion, Terrakion e Virizion do gelo. Os três agradecem Ash e seus amigos por terem apoiado Keldeo. Todos eles agora assistem a luta de Keldeo sem interferir. Kyurem retorna a sua forma normal. Durante a luta, Keldeo lembra dos ensinamentos de seus tutores e consegue lançar Kyurem para longe. Kyurem transforma-se no Kyurem Preto novamente e manda um golpe em Keldeo, congelando-o.
Quando tudo parecia perdido, Keldeo começa a brilhar e consegue se libertar do gelo sozinho. Finalmente ele havia despertado a sua espada, a espada secreta. Com ela conseguiu dar um golpe certeiro no Kyurem Preto. Kyurem fica feliz pois agora esta havia se tornado uma verdadeira batalha e dispara seu melhor golpe. O golpe iria atingir Ash, seus amigos e os espadas da justiça, mas Keldeo se joga na frente e parte o golpe em dois com seu chifre. Ele cai no chão ferido. O Kyurem Preto pisa em seu chifre e Keldeo admite a derrota. Kyurem volta a sua forma normal e diz estar impressionado sobre como ele preferiu salvar os seus amigos a ter que ganhar a batalha. Ele diz ainda que ele possui uma boa espada e depois vai embora. Cobalion diz que finalmente ele aprendeu a importância de sua espada. O local começa a desmoronar, Cobalion, Terrakion, Virizion e Keldeo salvam Ash e os outros. Kyurem muda para Kyurem Branco e impede que o local seja destruído. Do lado de fora, Cobalion, Tearrakion e Virizion finalmente aceitam Keldeo como um espada da justiça e os quatro reúnem seus chifre, dizendo o lema dos mosqueteiros, na presença de Ash, Cilan e Iris.